Pada lembaga penelitian Universitas Palangka Raya terdapat 8 (delapan) pusat penelitian, yaitu:
- Pusat Penelitian Kependudukan
- Pusat Penelitian Lingkungan Hidup
- Pusat Penelitian Kebudayaan Dayak
- Pusat Penelitian dan Pengembangan Pendidikan
- Pusat Penelitian Pembangunan Pedesaan
- Pusat Penelitian Studi Wanita
- Pusat Kajian makanan Tradisional dan Tanaman Obat-Obatan
- Pusat Penelitian Pedesaandan Ekonomi Kerakyatan dan Pengembangan IPTEK
- Pusat Penelitian Sumber Daya Lahan dan Pengairan
- Pusat Penelitian pengembangan Keolahragaan